Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms