Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms