Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Sh3bp5Q9Z131 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp5Q9Z131 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp5Q9Z131 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp5Q9Z131 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp5Q9Z131 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Sh3bp5Q9Z131 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp5Q9Z131 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Sh3bp5Q9Z131 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp5Q9Z131 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Sh3bp5Q9Z131 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp5Q9Z131 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp5Q9Z131 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
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Sh3bp5Q9Z131 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Sh3bp5Q9Z131 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Sh3bp5Q9Z131 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Sh3bp5Q9Z131 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Sh3bp5Q9Z131 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp5Q9Z131 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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