Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
NgfrQ9Z0W1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms