Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn9Q9Z0S7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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