Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AireQ9Z0E3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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