Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Carm1Q9WVG6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Carm1Q9WVG6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms