Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nme4Q9WV84 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nme4Q9WV84 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nme4Q9WV84 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nme4Q9WV84 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nme4Q9WV84 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nme4Q9WV84 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nme4Q9WV84 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nme4Q9WV84 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme4Q9WV84 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme4Q9WV84 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme4Q9WV84 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme4Q9WV84 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme4Q9WV84 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme4Q9WV84 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme4Q9WV84 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme4Q9WV84 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nme4Q9WV84 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms