Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ptpn4Q9WU22 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn4Q9WU22 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms