Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrkraQ9WTX2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms