Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tubd1Q9R1K7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubd1Q9R1K7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms