Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed2Q9R0Q3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed2Q9R0Q3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms