Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Plod3Q9R0E1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Plod3Q9R0E1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms