Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nek3Q9R0A5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nek3Q9R0A5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms