Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CtsjQ9R014 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsjQ9R014 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms