Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atp11cQ9QZW0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms