Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh2d3cQ9QZS8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d3cQ9QZS8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms