Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf4Q9QZS2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms