Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc1Q9QZF2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc1Q9QZF2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms