Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Copg1Q9QZE5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Copg1Q9QZE5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms