Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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VapbQ9QY76 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
VapbQ9QY76 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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