Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nufip1Q9QXX8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nufip1Q9QXX8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms