Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx8Q9QXV1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms