Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf354bQ9QXT9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf354bQ9QXT9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf354bQ9QXT9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf354bQ9QXT9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf354bQ9QXT9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf354bQ9QXT9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf354bQ9QXT9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf354bQ9QXT9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf354bQ9QXT9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf354bQ9QXT9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf354bQ9QXT9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf354bQ9QXT9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf354bQ9QXT9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf354bQ9QXT9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf354bQ9QXT9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf354bQ9QXT9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf354bQ9QXT9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf354bQ9QXT9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf354bQ9QXT9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf354bQ9QXT9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms