Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Copg2Q9QXK3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copg2Q9QXK3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms