Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rad18Q9QXK2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms