Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ChmQ9QXG2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ChmQ9QXG2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms