Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trp53inp1Q9QXE4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trp53inp1Q9QXE4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms