Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms