Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cln8Q9QUK3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln8Q9QUK3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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