Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkl2Q9QUK0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms