Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms