Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms