Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b2Q9JME5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b2Q9JME5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b2Q9JME5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b2Q9JME5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b2Q9JME5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b2Q9JME5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b2Q9JME5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b2Q9JME5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b2Q9JME5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b2Q9JME5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b2Q9JME5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b2Q9JME5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b2Q9JME5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b2Q9JME5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b2Q9JME5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b2Q9JME5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b2Q9JME5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3b2Q9JME5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ap3b2Q9JME5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ap3b2Q9JME5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap3b2Q9JME5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms