Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Rabgef1Q9JM13 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Rabgef1Q9JM13 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Rabgef1Q9JM13 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Rabgef1Q9JM13 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Rabgef1Q9JM13 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabgef1Q9JM13 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
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Rabgef1Q9JM13 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Rabgef1Q9JM13 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rabgef1Q9JM13 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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