Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Higd1aQ9JLR9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms