Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cabp1Q9JLK7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp1Q9JLK7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp1Q9JLK7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp1Q9JLK7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp1Q9JLK7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp1Q9JLK7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp1Q9JLK7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp1Q9JLK7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp1Q9JLK7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp1Q9JLK7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp1Q9JLK7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp1Q9JLK7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp1Q9JLK7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp1Q9JLK7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cabp1Q9JLK7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cabp1Q9JLK7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms