Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Col5a3Q9JLI2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Col5a3Q9JLI2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col5a3Q9JLI2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Col5a3Q9JLI2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Col5a3Q9JLI2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Col5a3Q9JLI2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Col5a3Q9JLI2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Col5a3Q9JLI2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col5a3Q9JLI2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms