Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CtsmQ9JL96 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CtsmQ9JL96 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms