Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Upk3aQ9JKX8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms