Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scamp4Q9JKV5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms