Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmod2Q9JKK7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmod2Q9JKK7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms