Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms