Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nectin1Q9JKF6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nectin1Q9JKF6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms