Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ap3m1Q9JKC8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap3m1Q9JKC8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms