Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Uchl3Q9JKB1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Uchl3Q9JKB1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms