Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msgn1Q9JK54 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Msgn1Q9JK54 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms