Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tuba8Q9JJZ2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tuba8Q9JJZ2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tuba8Q9JJZ2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tuba8Q9JJZ2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tuba8Q9JJZ2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tuba8Q9JJZ2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Tuba8Q9JJZ2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Tuba8Q9JJZ2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tuba8Q9JJZ2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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