Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Alyref2Q9JJW6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Alyref2Q9JJW6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Alyref2Q9JJW6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Alyref2Q9JJW6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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