Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms